ERC-funded Postdoctoral Researcher (m/f/d) in Zebrafish Optogenetics & Single-cell Genomics

Das Max Delbrück Center sucht für den Standort Berlin-Mitte eine:n ERC-finanzierte:n Postdoctoral Researcher im Bereich Zebrafish Optogenetics und Single-cell Genomics.

Die Forschungsgruppe entwickelt quantitative Modelle dazu, wie verschiedene epigenetische Ebenen der Transkriptionsregulation während der Embryonalentwicklung von Wirbeltieren interagieren. Die Position fokussiert auf systematische, räumlich und zeitlich kontrollierte Perturbationen von Signalwegen und Transkriptionsfaktor-Logik im Zebrafisch-Embryo mit induzierbaren und optogenetischen Ansätzen sowie Single-Cell-Multiome-Readouts.

Aufgaben

Entwicklung und Umsetzung induzierbarer und optogenetischer Perturbationsstrategien für zentrale Signalwege wie Nodal, BMP, FGF, WNT und Retinsäure sowie ausgewählte Transkriptionsfaktoren in Zebrafisch-Embryonen.
Durchführung von Single-Cell-Multi-Omics-Profiling, darunter scRNA-seq, scATAC-seq, Multiome und gegebenenfalls räumliche Ansätze über relevante Entwicklungsstadien hinweg.
Aufbau robuster und skalierbarer experimenteller Pipelines für präzise räumliche und zeitliche Perturbationen in Kombination mit Hochdurchsatz-Molekularreadouts.
Enge Zusammenarbeit mit Computational Scientists zur Integration experimenteller Datensätze in quantitative Modelle der Genregulation und Entwicklungsdynamik.
Konzeptionelle Weiterentwicklung von Experimenten auf Basis computergestützter Vorhersagen und grundlegender Fragen der Entwicklungsbiologie.
Aktive Mitarbeit in einem hochgradig interdisziplinären und kollaborativen Forschungsumfeld.

Anforderungen

Promotion in Entwicklungsbiologie, Molekularbiologie, Biophysik oder einer verwandten lebenswissenschaftlichen Disziplin.
Praktische Erfahrung mit Zebrafisch- oder vergleichbaren Wirbeltier-Embryoexperimenten.
Erfahrung mit Single-Cell-Genomics-Methoden wie scRNA-seq, scATAC-seq oder Multiome ist sehr erwünscht.
Vertrautheit mit optogenetischen oder chemisch induzierbaren Perturbationssystemen ist von Vorteil.
Stark quantitative Denkweise und Interesse an enger Zusammenarbeit mit computergestützten Teammitgliedern.
Fähigkeit, sowohl selbstständig als auch kollaborativ in einem interdisziplinären Team zu arbeiten.

Wir bieten

Internationales Arbeitsumfeld mit Kommunikation auf Englisch und Deutsch.
Interessante Karrierechancen und vielfältige Möglichkeiten zur weiteren Qualifikation und Weiterbildung.
Vereinbarkeit von Familie und Beruf, zertifiziert durch das berufundfamilie-Audit.
Unterstützung für New Berliners durch das MDC Welcome & Family Office.
Vergütung nach TVöD Bund bis Entgeltgruppe E13 abhängig von den persönlichen Voraussetzungen inklusive zusätzlicher betrieblicher Altersversorgung.
Sicherer Arbeitsplatz, flexible Arbeitszeiten, Kinderbetreuungsunterstützung und Möglichkeit zum mobilen Arbeiten.
Grüner Campus mit guter Erreichbarkeit, Jobticket-Zuschuss, Kantinenrabatte sowie Gesundheits- und Fitnessangebote.

Rahmendaten

Arbeitsort: MDC Berlin-Mitte. Gewünschter Start: 01. September 2026. Befristung: 2 Jahre mit Option auf Verlängerung. Beschäftigungsausmaß: Vollzeit. Bewerbungsfrist: 02. Juli 2026.

Kontakt und Bewerbung

Bei Fragen wenden Sie sich an Markus Mittnenzweig, AG Mittnenzweig: markus.mittnenzweig@mdc-berlin.de.

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ERC-funded Postdoctoral Researcher (m/f/d) in Zebrafish Optogenetics & Single-cell Genomics

Das Max Delbrück Center sucht für den Standort Berlin-Mitte eine:n ERC-finanzierte:n Postdoctoral Researcher im Bereich Zebrafish Optogenetics und Single-cell Genomics.

Aufgaben

Entwicklung und Umsetzung induzierbarer und optogenetischer Perturbationsstrategien für zentrale Signalwege wie Nodal, BMP, FGF, WNT und Retinsäure sowie ausgewählte Transkriptionsfaktoren in Zebrafisch-Embryonen.
Durchführung von Single-Cell-Multi-Omics-Profiling, darunter scRNA-seq, scATAC-seq, Multiome und gegebenenfalls räumliche Ansätze über relevante Entwicklungsstadien hinweg.
Aufbau robuster und skalierbarer experimenteller Pipelines für präzise räumliche und zeitliche Perturbationen in Kombination mit Hochdurchsatz-Molekularreadouts.
Enge Zusammenarbeit mit Computational Scientists zur Integration experimenteller Datensätze in quantitative Modelle der Genregulation und Entwicklungsdynamik.
Konzeptionelle Weiterentwicklung von Experimenten auf Basis computergestützter Vorhersagen und grundlegender Fragen der Entwicklungsbiologie.
Aktive Mitarbeit in einem hochgradig interdisziplinären und kollaborativen Forschungsumfeld.

Anforderungen

Promotion in Entwicklungsbiologie, Molekularbiologie, Biophysik oder einer verwandten lebenswissenschaftlichen Disziplin.
Praktische Erfahrung mit Zebrafisch- oder vergleichbaren Wirbeltier-Embryoexperimenten.
Erfahrung mit Single-Cell-Genomics-Methoden wie scRNA-seq, scATAC-seq oder Multiome ist sehr erwünscht.
Vertrautheit mit optogenetischen oder chemisch induzierbaren Perturbationssystemen ist von Vorteil.
Stark quantitative Denkweise und Interesse an enger Zusammenarbeit mit computergestützten Teammitgliedern.
Fähigkeit, sowohl selbstständig als auch kollaborativ in einem interdisziplinären Team zu arbeiten.

Wir bieten

Internationales Arbeitsumfeld mit Kommunikation auf Englisch und Deutsch.
Interessante Karrierechancen und vielfältige Möglichkeiten zur weiteren Qualifikation und Weiterbildung.
Vereinbarkeit von Familie und Beruf, zertifiziert durch das berufundfamilie-Audit.
Unterstützung für New Berliners durch das MDC Welcome & Family Office.
Vergütung nach TVöD Bund bis Entgeltgruppe E13 abhängig von den persönlichen Voraussetzungen inklusive zusätzlicher betrieblicher Altersversorgung.
Sicherer Arbeitsplatz, flexible Arbeitszeiten, Kinderbetreuungsunterstützung und Möglichkeit zum mobilen Arbeiten.
Grüner Campus mit guter Erreichbarkeit, Jobticket-Zuschuss, Kantinenrabatte sowie Gesundheits- und Fitnessangebote.